Genç kadın savaşçı Deunan ve tecrübeli cyborg-asker Briareos hem partner hem de sevgilidir. Olympus'a hizmet eden E.S.W.A.T'nin üyeleri olarak, her soruna onlar bakmaktadır. İki savaşçı, ortaklığını, Tereus adında deneysel Bioroid'in aralarına katılmasıyla tes eder.
009 Re:Cyborg follows a group of nine cyborgs, each of them created by a shadowy organization for use as weapons against humanity. The group turns on their creators to protect the population instead, using the powers given them to fight their creators.
A mysterious suicide and a series of unmanned robot run-aways sparks off a Police investigation into the suspicious software on-board thousands of industrial robots around Tokyo.
Kendine kendine genişleyen ve tüm yaşamı yok eden uçsuz bucaksız bir şehirde, gizemli ve yalnız bir adam, geride kalanlara yol göstererek ederek insanlığı kurtarmalıdır.